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harvest-corpus / outils / stats-corpus / statsCorpus.pl
#!/usr/bin/perl


# Déclaration des pragmas
use strict;
use utf8;
use open qw/:std :utf8/;

# Appel des modules externes de base
use Encode qw(decode_utf8 encode_utf8 is_utf8);
use Getopt::Long;

# Appel des modules spécifiques à l'application
## use URI::Encode qw(uri_encode uri_decode);
## use LWP::Simple;
use JSON;
## use Text::Unidecode;

my ($programme) = $0 =~ m|^(?:.*/)?(.+)|;
my $substitut = " " x length($programme);

my $usage = "Usage : \n" .
            "    $programme -l logfile -c fichier.corpus [ -r répertoireXML ] [ -s sortie ] \n" .
            "    $substitut [ -f (csv|json|tsv) ] [ -x (normal|lodex) ] \n" .
            "    $programme -m répertoireJSON [ -r répertoireXML ] [ -s sortie ] \n" .
            "    $substitut [ -f (csv|json|tsv) ] [ -x (normal|lodex) ] \n".
            "    $programme -h \n";

my $version   = "3.0.0";
my $dateModif = "1 Juin 2018";

# Variables pour les options
my $aide        = 0;
my $corpus      = "";
my $logfile     = "";
my $metadata    = "";
my $prefixe     = "";
my $repertoire  = "";
my $sortie      = "";
my $type        = "";
my $xtended     = "";

eval	{
	$SIG{__WARN__} = sub {usage(1);};
	GetOptions(
		"corpus=s"      => \$corpus,
		"format=s"      => \$type,
		"help"          => \$aide,
		"logfile=s"     => \$logfile,
		"metadonnees=s" => \$metadata,
		"prefixe=s"     => \$prefixe,
		"repertoire=s"  => \$repertoire,
		"sortie=s"      => \$sortie,
		"xtended=s"     => \$xtended,
		);
	};
$SIG{__WARN__} = sub {warn $_[0];};

if ( $aide ) {
	print "Programme : \n";
	print "    “$programme”, version $version ($dateModif)\n";
	print "    Permet de faire des statistiques sur les fichiers extraits d’ISTEX en utilisant le fichier \n";
	print "    de métadonnées “logRequete.txt” (cf. l’option “-v” du programme “harvestCorpus.pl”) ou les \n";
	print "    fichiers de métadonnées JSON correspondants aux documents extraits. \n";
	print "    Si les fichiers XML éditeurs ont été extraits, il permet aussi de vérifier s’ils ont ou non \n";
	print "    les documents sous forme de texte structuré. \n";
	print "\n";
	print $usage;
	print "\nOptions : \n";
	print "    -c  indique le nom du fichier “.corpus” généré par le programme “harvestCorpus.pl” permettant \n";
	print "        de faire le lien entre l’identifiant ISTEX ou ARK d’un document et le nom des fichiers \n";
	print "        extraits correspondants.\n";
	print "    -f  indique le format de sortie, à savoir TSV (par défaut), CSV ou JSON. \n";
	print "    -h  affiche cette aide. \n";
	print "    -l  indique le nom du fichier “logfile” contenant les métadonnées ISTEX au format JSON \n";
	print "        créé par l’option “-v” du programme “harvestCorpus.pl”. Par défaut, ce fichier \n";
	print "        s’appelle “logRequete.txt” et se trouve dans le répertoire des fichiers déchargés \n";
	print "        depuis le serveur ISTEX. \n";
	print "    -m  indique le répertoire où se trouve les fichiers de métadonnées au format JSON déchargés \n";
	print "        par le programme “harvestCorpus.pl” (what else?).\n";
# 	print "    -p  indique le préfixe utilisé au début du nom des fichiers déchargés par le programme \n";
# 	print "        “harvestCorpus.pl”. \n";
	print "    -r  indique le répertoire où se trouve les fichiers XML éditeurs obtenus à partir des \n";
	print "        fichiers ZIP déchargés par le programme “harvestCorpus.pl”. Si les fichiers XML sont \n";
	print "        dans le même répertoire que les fichiers JSON, l’option “-m” seule suffit. \n";
	print "    -s  indique le nom du fichier de sortie. Sinon, la sortie se fait sur la sortie standard. \n";
	print "        Si l'extension du fichier de sortie est “.csv”, “.json” ou “.tsv”, le format correspondant \n";
	print "        est utilisé. \n";
	print "    -x  étend la liste des champs affichés, soit en mode normal, soit en mode “lodex”, \n";
	print "        c'est-à-dire avec un lien, affiché en exposant, entre auteurs et affiliations. \n";
	print "\nExemples : \n";
	print "    $programme -l Arthropodes/logRequete.txt -c Arthropodes_v2b.corpus -r Arthropodes\n";
	print "    $programme -m Vieillissement -r Vieillissement -s Vieil.tsv \n";
	print "    $programme -m Vieillissement -s Vieil.tsv                     (identique au précédent)\n";
	print "    $programme -m Vieillissement -s Vieil.txt -f csv -x lodex     (en CSV, prêt pour Lodex)\n";
	print "    $programme -m Vieillissement -s Vieil.csv -x lodex            (idem)\n";
	print " \n";

	exit 0;
	}

# Premier test sur la présence des options obligatoires
usage(2) if $logfile and not $corpus;
usage(2) if $corpus and not $logfile;
usage(2) if not $logfile and not $metadata;
if ( $metadata and not -d $metadata ) {
	print STDERR "$programme : le répertoire \"$metadata\" n’existe pas !\n";
	exit 3;
	}

# Test sur le format de sortie
if ( $type ) {
	if ( $type !~ /^(csv|json|tsv)\z/oi ) {
		print STDERR "$programme : le format de fichier \"$type\" n’est pas correct !\n";
		usage(4);
		}
	$type = lc($type);
	}

# Test de l’existence d’un nom de fichier de sortie  
# et de son extension avant ouverture de celui-ci
if ( $sortie ) {
	if ( $sortie =~ /\.(csv|json|tsv)\z/oi ) {
		my $tmp = lc($1);
		if ( $type and $type ne $tmp ) {
			print STDERR "$programme : le format \"$type\" et l’extension \"$tmp\" ne sont pas compatible !\n";
			exit 5;
			}
		$type = $tmp;
		}
	open(OUT, ">:utf8", $sortie) or die "\"$sortie\" : $!,";
	}
# Ou bien, renvoi sur la sortie standard
else	{
	open(OUT, ">&STDOUT") or die "$!,";
	binmode(OUT, ">:utf8");
	}

$type = "tsv" if not $type;

if ( $xtended ) {
	if ( $xtended !~ /^(normal|lodex)\z/oi ) {
		print STDERR "$programme : mauvais argument pour l’option “-x” !\n";
		usage(6);
		}
	$xtended = lc ($xtended);
	}

# Autres variables globales
my $entete = "";
my $format = "";
my $json   = "";
my $nbDocs = 0;
my $num    = 0;
my $racine = "";
my $total  = 0;
my @champs = ();
my %racine = ();

# Verbalisation des codes langues ISO 639-2
my %langue = langues();

# Liste des noms des éditeurs
my %nom = (
	"elsevier"           => "Elsevier",
	"wiley"              => "Wiley",
	"springer-journals"  => "Springer (journals)",
	"oup"                => "OUP",
	"cambridge"          => "Cambridge",
	"sage"               => "Sage",
	"bmj"                => "BMJ",
	"springer-ebooks"    => "Springer (e-books)",
	"iop"                => "IOP",
	"nature"             => "Nature",
	"rsc-journals"       => "RSC (journals)",
	"degruyter-journals" => "Degruyter (journals)",
	"ecco"               => "ECCO",
	"edp-sciences"       => "EDP Sciences",
	"emerald"            => "Emerald",
	"brill-journals"     => "Brill (journals)",
	"eebo"               => "EEBO",
	"rsc-ebooks"         => "RSC (e-books)",
	"brill-hacco"        => "Brill HACCO",
	"gsl"                => "GSL",
	"numerique-premium"  => "Numérique Premium",
	);

if ( $xtended ) {
	@champs = ("Nom de fichier", "Titre", "Auteur(s)", "Affiliation(s)", 
		   "Revue ou monographie", "ISSN", "e-ISSN", "ISBN", "e-ISBN", 
		   "Éditeur", "Type de publication", "Type de document", 
		   "Date de publication", "Langue(s) du document", "Résumé", 
		   "Mots-clés d’auteur", "Catégories WoS", "Catégories Science-Metrix", 
		   "Catégories Scopus", "Catégories INIST", "Score qualité", 
		   "Version PDF", "XML structuré", "Identifiant ISTEX", "ARK", 
		   "DOI", "PMID");
	}
else	{
	@champs = ("Identifiant ISTEX", "ARK", "Nom de fichier", "Éditeur", 
		   "Score qualité", "Version PDF", "XML structuré", 
		   "Date de publication", "Titre", "Revue", "ISSN", 
		   "e-ISSN", "Type de publication", "Type de document", 
		   "Catégories WoS", "Catégories Science-Metrix", 
		   "Catégories Scopus", "Catégories INIST");
	}

my $entete = join("\t", @champs);
if ( $type eq "csv" ) {
	print OUT "\x{FEFF}" . tsv2csv($entete) . "\n";
	}
elsif ( $type eq "tsv" ) {
	print OUT "\x{FEFF}$entete\n";
	}

if ( $logfile ) {
	# Lecture du fichier “.corpus” ...
	if ( not -f $corpus ) {
		print STDERR "Erreur : fichier \"$corpus\" absent\n";
		exit 14;
		}
	elsif ( $corpus =~ /\.g?[zZ]\z/ ) {
		open(TAB, "gzip -cd $corpus |") or 
			die "Erreur : Impossible d'ouvrir \"$corpus\" : $!,";
		binmode(TAB, ":utf8");
		}
	elsif ( $corpus =~ /\.bz2\z/ ) {
		open(TAB, "bzip2 -cd $corpus |") or 
			die "Erreur : Impossible d'ouvrir \"$corpus\" : $!,";
		binmode(TAB, ":utf8");
		}
	else	{
		open(TAB, "<:utf8", $corpus) or 
			die "Erreur : Impossible d'ouvrir \"$corpus\" : $!,";
		}
	my $nbIds = 0;
	while(<TAB>) {
		if ( m|^total +: (\d+) (/ \d+ )?documents|o ) {
			$nbDocs = $1;
			}
		if ( /^(ark|id) /o ) {
			chomp;
			$nbIds ++;
			s/\r//go;	# Au cas où ...
			my ($type, $id, $com, $nom) = split(/\s+/);
			if ( $type eq 'ark' and $id !~ /^ark:/o ) {
				$id = "ark:$id";
				}
			$racine{$id} = $nom;
			}
		}
	close TAB;
	if (  not $nbDocs and $nbIds ) {
		$nbDocs = $nbIds
		}
	if ( $type eq 'json' ) {
		print OUT "{\n  \"total\": $nbDocs,\n  \"docs\": [\n";
		}

	# ... avant la lecture du fichier “logRequete”
	if ( not -f $logfile ) {
		print STDERR "Erreur : fichier \"$logfile\" absent\n";
		exit 14;
		}
	elsif ( $logfile =~ /\.g?[zZ]\z/ ) {
		open(INP, "gzip -cd $logfile |") or 
			die "Erreur : Impossible d'ouvrir \"$logfile\" : $!,";
		binmode(INP, ":raw");
		}
	elsif ( $logfile =~ /\.bz2\z/ ) {
		open(INP, "bzip2 -cd $logfile |") or 
			die "Erreur : Impossible d'ouvrir \"$logfile\" : $!,";
		binmode(INP, ":raw");
		}
	else	{
		open(INP, "<:raw", $logfile) or 
			die "Erreur : Impossible d'ouvrir \"$logfile\" : $!,";
		}
	while(<INP>) {
		if ( /^# (\w+_?\d+)/ ) {
			$racine = $1;
			next;
			}
		elsif ( /^#/ ) {
			next;
			}
		$json .= $_;
		if ( /^\}/o ) {
			my $perl = decode_json $json;
			my %top = %{$perl};
			if ( defined $top{'total'} ) {
				$total = $top{'total'};
				if ( $total > 0 ) {
					$format = sprintf("%%0%dd", length($total) + 1);
					}
				}
			if ( defined $top{'hits'} ) {
				my @hits = @{$top{'hits'}};
				foreach my $hit (@hits) {
					traite($hit);
					}
				}
			else	{
				traite($perl);
				}
			$json = "";
			}
		}
	}
elsif ( $metadata ) {
	opendir(DIR, $metadata) or die "$!,";
	my @fichiers = sort grep(/\.json$/, readdir DIR);
	closedir DIR;

	$nbDocs = $#fichiers + 1;
	if ( $type eq 'json' ) {
		print OUT "{\n  \"total\": $nbDocs,\n  \"docs\": [\n";
		}

	foreach my $fichier (@fichiers) {
		($racine) = $fichier =~ /^(.+)\.json\z/o;
		open(JSN, "<:raw", "$metadata/$fichier") or die "$!,";
		while(<JSN>) {
			$json .= $_;
			if ( /^\}/o ) {
				my $perl = decode_json $json;
				traite($perl);
				$json = "";
				}
			}
		close JSN;
		}
	}
if ( $type eq 'json' ) {
	print OUT "  ]\n}\n";
	}
close OUT;


exit 0;


sub usage
{
print STDERR $usage;

exit shift;
}

sub traite
{
my $ref = shift;

$num ++;
my $fichier = undef;
my $xml     = undef;
my @valeurs = ();
my %hit = %{$ref};
my $id = $hit{'id'};
my $ark = $hit{'arkIstex'};
if ( $racine ) {
	$fichier = $racine;
	$racine = "";
	}
elsif ( $racine{$ark} ) {
	$fichier = $racine{$ark};
	}
elsif ( $racine{$id} ) {
	$fichier = $racine{$id};
	}
elsif ( $prefixe ) {
	$fichier = "$prefixe" . sprintf($format, $num);
	}
if ( defined $fichier ) {
	if ( $repertoire ) {
		$xml = "$repertoire/$fichier.xml";
		}
	elsif ( $metadata ) {
		$xml = "$metadata/$fichier.xml";
		}
	}
else	{
	$fichier = "Nom de fichier inconnu";
	}
my $titre = $hit{'title'};
my $corpusName = $hit{'corpusName'};
my $nom = $corpusName;
if ( $nom{$nom} ) {
	$nom = $nom{$nom};
	}

# À REVOIR !!!
my $date = "";
my $copyrightDate   = "";
my $publicationDate = "";

if ( $hit{'copyrightDate'} ) {
	$copyrightDate = $hit{'copyrightDate'};
	}
if ( $hit{'publicationDate'} ) {
	$publicationDate = $hit{'publicationDate'};
	}
if ( $copyrightDate and $publicationDate ) {
	if ( $copyrightDate == $publicationDate ) {
		$date = $copyrightDate;
		}
	elsif ( $copyrightDate =~ /^[12]\d\d\d\z/o ) {
		$date = $copyrightDate;
		}
	else	{
		$date = $publicationDate;
		}
	}
elsif ( $copyrightDate ) {
	$date = $copyrightDate;
	}
elsif ( $publicationDate ) {
	$date = $publicationDate;
	}
else	{
	$date = "S.D.";
	}


my $langues = "";
if ( defined $hit{'language'} ) {
	$langues = join(" ; ", @{$hit{'language'}}) if $type ne 'json';
	$langues = \@{$hit{'language'}} if $type eq 'json';
	}
elsif ( $type eq 'json' ) {
	$langues = [];
	}
my $wos           = "";
my $scienceMetrix = "";
my $scopus        = "";
my $inist         = "";
if ( defined $hit{'categories'} ) {
	my %categories = %{$hit{'categories'}};
	if ( defined $categories{'wos'} ) {
		$wos = join(" ; ", @{$categories{'wos'}}) if $type ne 'json';
		$wos = \@{$categories{'wos'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$wos = [];
		}
	if ( defined $categories{'scienceMetrix'} ) {
		$scienceMetrix = join(" ; ", @{$categories{'scienceMetrix'}}) if $type ne 'json';
		$scienceMetrix = \@{$categories{'scienceMetrix'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$scienceMetrix = [];
		}
	if ( defined $categories{'scopus'} ) {
		$scopus = join(" ; ", @{$categories{'scopus'}}) if $type ne 'json';
		$scopus = \@{$categories{'scopus'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$scopus = [];
		}
	if ( defined $categories{'inist'} ) {
		$inist = join(" ; ", @{$categories{'inist'}}) if $type ne 'json';
		$inist = \@{$categories{'inist'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$inist = [];
		}
	}
elsif ( $type eq 'json' ) {
	$wos = [];
	$scienceMetrix = [];
	$scopus = [];
	$inist = [];
	}
my $genre = "";
if ( defined $hit{'genre'} ) {
	$genre = join(", ", @{$hit{'genre'}}) if $type ne 'json';
	$genre = \@{$hit{'genre'}} if $type eq 'json';
	}
elsif ( $type eq 'json' ) {
	$genre = [];
	}
my $pdfVersion = "";
my $score = "";
if ( defined $hit{'qualityIndicators'} ) {
	my %indicateurs = %{$hit{'qualityIndicators'}};
	if ( defined $indicateurs{'pdfVersion'} ) {
		$pdfVersion = $indicateurs{'pdfVersion'};
		}
	if ( defined $indicateurs{'score'} ) {
		$score = $indicateurs{'score'};
		}
	}
my $revue = "";
my $isbn  = "";
my $eisbn = "";
my $issn  = "";
my $eissn = "";
my $dt    = "";
if ( defined $hit{'host'} ) {
	my %host = %{$hit{'host'}};
	if ( defined $host{'title'} ) {
		$revue = $host{'title'}
		}
	if ( defined $host{'isbn'} ) {
		$isbn = join("/", @{$host{'isbn'}}) if $type ne 'json';
		$isbn = \@{$host{'isbn'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$isbn = [];
		}
	if ( defined $host{'eisbn'} ) {
		$eisbn = join("/", @{$host{'eisbn'}}) if $type ne 'json';
		$eisbn = \@{$host{'eisbn'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$eisbn = [];
		}
	if ( defined $host{'issn'} ) {
		$issn = join("/", @{$host{'issn'}}) if $type ne 'json';
		$issn = \@{$host{'issn'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$issn = [];
		}
	if ( defined $host{'eissn'} ) {
		$eissn = join("/", @{$host{'eissn'}}) if $type ne 'json';
		$eissn = \@{$host{'eissn'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$eissn = [];
		}
	if ( defined $host{'genre'} ) {
		$dt = join(", ", @{$host{'genre'}}) if $type ne 'json';
		$dt = \@{$host{'genre'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$dt = [];
		}
	}
my $structure = "Absent";
if ( defined $xml and -f $xml ) {
	$structure = "Non";
	my $texte = "";
	open(XML, "<:utf8", $xml) or die "$!,";
	while(<XML>) {
		tr/\n\r/ /s;
		$texte .= $_;
		}
	close XML;
	if ( $corpusName eq 'bmj' or
	     $corpusName =~ /^brill-/o or
	     $corpusName eq 'cambridge' or
	     $corpusName =~ /^degruyter-/o or
	     $corpusName eq 'edp-sciences' or
	     $corpusName eq 'emerald' or
	     $corpusName eq 'gsl' or
	     $corpusName eq 'numerique-premium' or
	     $corpusName eq 'oup' ) {
		$structure = "Oui" if $texte =~ m{<body>.+</(sec|p)>.*</body>}o;
		}
	elsif ( $corpusName eq 'ecco' ) {
		$structure = "Oui" if $texte =~ /<p>\s*<wd\b/o;
		}
	elsif ( $corpusName eq 'elsevier' ) {
		$structure = "Oui" if $texte =~ /<body>\s*<ce:sections>\s*<ce:section>/oi;
		}
	elsif ( $corpusName eq 'iop' ) {
		$structure = "Oui" if $texte =~ /<body( .+?)?>\s*<sec-level1\b/o;
		}
	elsif ( $corpusName eq 'nature' ) {
		$structure = "Oui" if $texte =~ m|<bdy>|o;
		$structure = "Non" if $texte =~ m|<bdy/>|o;
		}
	elsif ( $corpusName =~ /^rsc-/o ) {
		$structure = "Oui" if $texte =~ m|<art-body>\s*<section |o;
		}
	elsif ( $corpusName eq 'sage' ) {
		if ( $texte =~ /<body>\s*<full_text\b/o ) {
			$structure = "Non"
			}
		elsif ( $texte =~ m{<body>.+</(sec|p)>.*</body>}o ) {
			$structure = "Oui";
			}
		}
	elsif ( $corpusName =~ /^springer-/o ) {
		$structure = "Non" if $texte =~ m|<NoBody\b|o;
		}
	elsif ( $corpusName eq 'wiley' ) {
		$structure = "Oui" if $texte =~ /<body( .+?)?>\s*<section\b/oi;
		}
	else	{
		$structure = "Indéterminé";
		}
	}

if ( $xtended ) {
	# Variables spécifiques à l'affichage étendu
	my $auteurs      = "";
	my $affiliations = "";
	my $langues      = "";
	my $resume       = "";
	my $motscles     = "";
	my $doi          = "";
	my $pmid         = " ";
	if ( $hit{'author'} ) {
		my @authors = @{$hit{'author'}};
		my @names = ();
		my @affiliations = ();
		my %affiliations = ();
		my %lien         = ();
		foreach my $author (@authors) {
			my %author = %{$author};
			if ( $author{'name'} ) {
				push(@names, $author{'name'});
				}
			if ( $author{'affiliations'} ) {
				foreach my $affiliation (@{$author{'affiliations'}}) {
					next if $affiliation =~ /^\s*e-mail\s?:\s/io;
					if ( not $affiliations{$affiliation} ) {
						push(@affiliations, $affiliation);
						$affiliations{$affiliation} = $#affiliations + 1;
						}
					if ( $author{'name'} ) {
						$lien{$#names + 1}{$affiliations{$affiliation}} ++;
						}
					}
				}
			}
		if ( @names ) {
			if ( $#names > 0 and $xtended eq 'lodex' ) {
				for ( my $n = 0 ; $n <= $#names ; $n ++ ) {
					my $tmp = join(",", sort {$a <=> $b} keys %{$lien{$n + 1}});
					if ( $tmp ) {
						$names[$n] .= " <sup>$tmp</sup>";
						}
					}
				}
			$auteurs = join(" ; ", @names) if $type ne 'json';
			$auteurs = \@names if $type eq 'json';
			}
		if ( @affiliations ) {
			if ( $#names > 0 and $xtended eq 'lodex' ) {
				for ( my $n = 0 ; $n <= $#affiliations ; $n ++ ) {
					$affiliations[$n] = $n + 1 . ") $affiliations[$n]";
					}
				}
			$affiliations = join(" ; ", @affiliations) if $type ne 'json';
			$affiliations = \@affiliations if $type eq 'json';
			}
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$auteurs = [];
		$affiliations = [];
		}
	if ( $hit{'language'} ) {
		my @langues = @{$hit{'language'}};
		foreach my $item (@langues) {
			if ( $langue{$item} ) {
				$item = $langue{$item};
				}
			else	{
				print STDERR "Attention : pas de verbalisation pour le code langue \"$item\"\n";
				}
			}
		$langues = join(" ; ", @langues) if $type ne 'json';
		$langues = \@langues if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$langues = [];
		}
	if ( $hit{'abstract'} ) {
		$resume = $hit{'abstract'};
		$resume =~ s/^(abstract|summary)\s*:\s*//io;
		}
	if ( $hit{'doi'} ) {
		$doi = join(" ; ", @{$hit{'doi'}}) if $type ne 'json';
		$doi = \@{$hit{'doi'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$doi = [];
		}
	if ( $hit{'pmid'} ) {
		$pmid = join(" ; ", @{$hit{'pmid'}}) if $type ne 'json';
		$pmid = \@{$hit{'pmid'}} if $type eq 'json';
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$pmid = [];
		}
	if ( $hit{'subject'} ) {
		my @tmp = ();
		foreach my $subject (@{$hit{'subject'}}) {
			my %subject = %{$subject};
			if ( $subject{'value'} ) {
				push(@tmp, $subject{'value'})
				}
			}
		my %tmp = ();
		if ( $type eq 'json' ) {
			my @motscles = grep {not $tmp{$_} ++;} @tmp;
			$motscles = \@motscles;
			}
		else	{
			$motscles = join(" ; ", grep {not $tmp{$_} ++;} @tmp);
			}
		# Pourquoi cette substitution ?
		# $motscles =~ s| / | ; |go;
		}
	elsif ( $type eq 'json' ) {
		$motscles = [];
		}

	my @valeurs = ($fichier, $titre, $auteurs, $affiliations, $revue, $issn, $eissn, 
		       $isbn, $eisbn, $nom, $dt, $genre, $date, $langues, $resume, $motscles, 
		       $wos, $scienceMetrix, $scopus, $inist, $score, $pdfVersion, $structure, 
		       $id, $ark, $doi, $pmid);
	if ( $type eq 'json' ) {
		json(@valeurs);
		}
	else	{
		my $ligne = join("\t", @valeurs);
		if ( $type eq "csv" ) {
			print OUT tsv2csv($ligne), "\n";
			}
		elsif ( $type eq 'tsv' ) {
			print OUT "$ligne\n";
			}
		}
	}
else	{
	my @valeurs = ($id, $ark, $fichier, $nom, $score, $pdfVersion, $structure, $date, 
		       $titre, $revue, $issn, $eissn, $dt, $genre, $wos, $scienceMetrix, 
		       $scopus, $inist);
	if ( $type eq 'json' ) {
		json(@valeurs);
		}
	else	{
		my $ligne = join("\t", @valeurs);
		if ( $type eq "csv" ) {
			print OUT tsv2csv($ligne), "\n";
			}
		elsif ( $type eq 'tsv' ) {
			print OUT "$ligne\n";
			}
		}
	}
}

sub tsv2csv
{
my $ligne = shift;

my @champs = split(/\t/, $ligne);
foreach my $champ (@champs) {
	if ( $champ =~ /[",;]/o ) {
		$champ =~ s/"/""/go;
		$champ = "\"$champ\"";
		}
	}

return join(";", @champs);
}

sub json
{
my @valeurs = @_;

$nbDocs --;
my $nb = $#champs;
print OUT "    {\n";
foreach my $champ (@champs) {
	my $valeur = shift @valeurs;
	if ( ref($valeur) eq 'ARRAY' ) {
		my @tmp = @{$valeur};
		print OUT "      \"$champ\": [\n";
		while(my $tmp = shift @tmp) {
			if ( $tmp =~ /^\d+\z/o ) {
				print OUT "        $tmp";
				}
			else	{
				print OUT "        \"$tmp\"";
				}
			print OUT "," if $#tmp > -1;
			print OUT "\n";
			}
		print OUT "      ]";
		print OUT "," if $nb;
		print OUT "\n";
		}
	else	{
		if ( $valeur =~ /^\d+\z/o ) {
			print OUT "      \"$champ\": $valeur";
			}
		else	{
			print OUT "      \"$champ\": \"$valeur\"";
			}
		print OUT "," if $nb;
		print OUT "\n";
		}
	$nb --;
	}
if ( $nbDocs ) {
	print OUT "    },\n";
	}
else	{
	print OUT "    }\n";
	}
}

sub langues
{
return (
	"alg" => "Langues algonquines",
	"amh" => "Amharique",
	"ang" => "Anglo-saxon (env.450-1100)",
	"ara" => "Arabe",
	"arc" => "Araméen d'empire (700-300 av. J.C.)",
	"arm" => "Arménien",
	"cat" => "Catalan",
	"chi" => "Chinois",
	"cze" => "Tchèque",
	"dan" => "Danois",
	"dut" => "Néerlandais",
	"eng" => "Anglais",
	"fre" => "Français",
	"frm" => "Moyen français (1400-1600)",
	"fro" => "Ancien français (842-env.1400)",
	"ger" => "Allemand",
	"gla" => "Gaélique écossais",
	"gle" => "Irlandais",
	"glg" => "Galicien",
	"glv" => "Mannois",
	"gmh" => "Moyen haut-allemand(env. 1050-1500)",
	"grc" => "Grec ancien (jusqu'en 1453)",
	"gre" => "Grec moderne",
	"heb" => "Hébreu",
	"hun" => "Hongrois",
	"ita" => "Italien",
	"lat" => "Latin",
	"lit" => "Lituanien",
	"may" => "Malais",
	"moh" => "Mohawk",
	"mul" => "Multilingue",
	"nai" => "Langues nord-amérindiennes",
	"new" => "Newari",
	"nor" => "Norvégien",
	"pal" => "Pahlavi",
	"peo" => "Vieux perse (env. 600-400 av. J.C.)",
	"per" => "Persan",
	"pol" => "Polonais",
	"por" => "Portugais",
	"roa" => "Langues romanes",
	"rus" => "Russe",
	"san" => "Sanskrit",
	"sco" => "Écossais",
	"spa" => "Espagnol",
	"swe" => "Suédois",
	"syr" => "Syriaque",
	"tur" => "Turc",
	"und" => "Indéterminé",
	"unknown" => "Indéterminé",
	"wel" => "Gallois",
	"zxx" => "Pas de contenu linguistique",
	);
}